二十五、辦理支付之處理程序如下：
        (一)驗對簽證印鑑。
        (二)審核付款憑單內容。
        (三)收件登錄。
        (四)登錄預算科目資料及查對餘額。
        (五)登錄匯款資料及簽發支票。
        (六)覆核匯款資料或支票。
        (七)匯款資料傳送及支票封發。銷之金額，財政局應依
　　　　  序編號登記後，調整其有關科目餘額。

二十六、財政局應依主計處核定彙轉之各機關年度預算、歲出分配預算、
        歲出保留款、其他核定支付經費或各機關其他款項繳款書等，據
        以辦理費款支付，並即建立資料檔，確實查驗保存。
        各機關辦理支出收回或市庫支票註銷之金額，財政局應依序編號
        登記後，調整其有關科目餘額。

二十七、財政局收到各機關放行之支付憑單，應分別編號登記於各該收件
        登記簿。

二十八、支付憑單經編號登記後應核對下列事項：
        (一)簽證人員簽證是否相符。
        (二)支付科目有無餘額可供支付或轉出。查對時應注意下列事項
            ：
             1、歲出分配預算各有關支付科目截至當時止之餘額，其下
                月或下期之分配預算，不得視為當時之餘額。
             2、歲出保留款之核准保留餘額，其有分期支用之規定者，
                依其規定。
             3、存入市庫存款戶之特種基金及保管款，支付時應查對其
                結存餘額。
             4、待追查之損失庫款重新支付時，應以財政局簽具之會計
                憑證所列實際發生損失款額為依據。
        (三)其他項目有無錯誤或遺漏，及是否符合規定。
        (四)對於支付憑單內容有疑義時，財政局得要求該機關補送佐證
            資料憑辦。
        (五)各機關傳送資料與財政局接收資料不一致而產生財務責任時
            ，應依行政院主計總處備份資料予以確認，必要時得委請政
            府憑證管理中心或雙方認可之公正機構，判定其責任歸屬。

二十九、支付憑單有下列情形之一者，應由財政局標註退回原因，退還編
        製機關，並登錄備查：
        (一)餘額不足。
        (二)與支付法案或其他法令規章不符。
        (三)支付法案尚未到達，無付款或轉帳依據。
        (四)附件遺漏或不符。
        (五)科目名稱及代號漏列或錯誤。
        (六)支出用途漏列、錯誤，憑單編號漏列、重複。
        (七)金額及受款人漏列、錯誤。
        (八)存入金融機構之代號及名稱、帳號或戶名漏列、不全、不符
            。
        (九)大寫小寫金額不符。
        (十)受款人及金額以外各欄位漏列、錯誤。
        (十一)憑單未填註領取支票憑證編號。
        (十二)超過額定零用金限額。
        (十三)轉帳收付兩方金額不符，或細數之和與總數不符。
        (十四)已逾支付或轉帳期限。
        (十五)各機關通知退回。
        (十六)科目清單或受款人清單總金額與付款憑單金額不符。
        (十七)支票領取方式採用二種以上或漏列。
        (十八)指定兌付代庫銀行名稱欄位，填列二個以上代理銀行。
        (十九)轉帳憑單收付方一級科目相同。
        (二十)附記事項應填列事項漏列。
        (二十一)以其他為退回理由，未註明無法辦理之事實。

三十、支付憑單經查核相符後，記帳人員應將相關資料檔更新，調整其有
      關科目餘額。

三十一、各機關支出市庫之款項支用減少，應收回其全部或部分者，如屬
        於當年度預算執行（含歲出保留款），應以原支出科目填具支出
        收回書，連同應繳回之款項，一併繳還市庫；如屬於以前年度者
        ，應填具收入繳款書(以下簡稱繳款書)，按原支出性質，分別以
        收回以前年度歲出之科目或適當科目繳還市庫。

三十二、財政局簽開市庫支票，應依據手續完備之付款憑單，原則於八個
        工作小時內簽妥。

三十三、市庫支票應劃平行線並載明禁止背書轉讓。但具有下列情形之一
        者，得依各機關付款憑單特別記載事項註明，免劃平行線：
        (一)機關預付費用。
        (二)受款人非政府機關或公營事業機構。
        (三)票面金額未達新臺幣五十萬元。
        (四)自領或領回轉發支票。
        已開立劃線支票，如符合前項第一款至第三款規定之一者，得經
        各機關填具市庫支票取消劃線申請書，加蓋主辦會計人員簽證印
        鑑後，交由受款人持市庫支票及身分證明向財政局申請。
        前項情形受款人係個人，票面金額超過新臺幣五十萬元以上者，
        應經機關專案核准。

三十四、市庫支票或匯款資料簽發後，應覆核下列事項：
        (一)支票受款人及金額，匯款資料之金融機構名稱及代號、帳號
            、受款人及金額，確與付款憑單所列相符。
        (二)支票或匯款資料之簽發確屬符合規定。
        (三)支票上各項記載，確無字跡模糊，金額確無變更改寫。
        (四)支票確無污漬、摺皺或破損。
        (五)同一付款憑單支付金額總和，確與簽發之各支票或匯款資料
            金額總額相符。
        (六)市庫支票或匯款資料應按付款憑單庫款領取方式欄位記載予
            以區分，以利支票封發或匯款傳送。
        (七)付款憑單上各項程序，處理時確無遺漏。
        (八)有關支付之其他應注意事項。

三十五、市庫支票受款人及金額繕寫錯誤、污損、模糊或摺皺時，財政局
        應予作廢重行簽發，原付款憑單所列支票號碼應予更正；其他記
        載事項錯誤之更正，應於更正處加蓋財政局局長及集中支付科科
        長印鑑。

三十六、經覆核相符之市庫支票應蓋財政局局長及集中支付科科長印鑑。
        前項印鑑章，得利用機器處理。

三十七、付款憑單各欄位內容除受款人及金額不得修改外，其餘各欄位之
        修正，得經財政局同意後，通知該機關列印紙本憑單，於修正處
        加蓋主辦會計人員簽證印鑑後送財政局憑辦，轉帳憑單修正亦同
        。

三十八、財政局運用跨行通匯系統辦理通匯作業時，應依據手續完備之付
        款憑單指定入帳之金融機構代號、帳號、戶名及金額辦理，經審
        查核對e企授權自動扣帳匯款作業資料清單之匯款筆數、總金額
        無誤後彙轉為匯款電子檔，加密後分批傳送至代理銀行，於八個
        工作小時內完成整批匯款作業。

三十九、撥匯庫款遇退匯款時，財政局應依據代理銀行退匯資料查明原因
        後重匯，或通知原機關查明補正後改匯；若屬退匯無法補正案件
        ，應將原機關填製之支出收回書或繳款書送交代理銀行辦理轉帳
        。

四十、受款人自領或由各機關指定人員領回轉發之市庫支票，財政局應編
      製自轉領未領支票明細表，指定專人保管候領。
      前項支票領取時，財政局應核對領取支票憑證上所蓋受款人章或機
      關指定領取支票人員印鑑與所攜領款章相符後發給之；同時在收回
      之領取支票憑證上加蓋付訖日戳，收回之領取支票憑證應併同自轉
      領交付一覽表備查。

四十一、受款人委託代領市庫支票者，財政局應核對受款人及受託代領人
        具照片之身分證件及印章。
        受款人未在領取支票憑證上蓋章者，不得委託代領。

四十二、財政局應將各機關指定領取市庫支票人員之姓名、職稱、印鑑及
        身分證件號碼設表登記，並於領發支票時核對之。

四十三、郵寄之市庫支票以掛號寄發，必要時得以限時掛號寄發。
        財政局辦理市庫支票郵寄作業時，應按支票號碼、收件人姓名、
        住址、支票金額、收件編號及支票張數等，產製掛號信封，核對
        無誤後列印市庫支票郵寄送件單一併送郵局點收郵寄，並將郵局
        簽證之送件單訂存備查。無法寄達經退回之市庫支票，應予暫行
        收存登記，並通知原機關查明處理。

四十四、財政局應依據代理銀行提供之支出銷帳資料，逐日產製兌付（未
        兌）市庫支票清單，並依據市庫存款戶結存日報表加以核對調節
        ，如有不符，應即查明處理。並應按期編製庫款支付相關報表送
        審計處及主計處。

四十五、財政局完成支付程序後，各機關應至庫款支付查詢系統列印對帳
        單核對帳務，如有不符者，應於每月十日前填具對帳通知單，送
        財政局核對調節。

四十六、財政局辦理庫款支付如有誤付、重付或溢付情事，經查明尚未兌
        付者，應立即向代理銀行辦理止付。。

四十七、財政局誤付、重付或溢付之庫款，如業經兌付，應簽報局長核准
        ，按誤付、重付或溢付金額設簿轉列登記為應收回庫款並調整餘
        額，俟收回後再行沖銷。

四十八、誤付款之重新補付，財政局應檢齊原付款憑單及原簽准案詳加標
        註，簽報局長核准後辦理。

四十九、誤付、重付或溢付款項，應由財政局於三十日內追回，並按情節
        輕重議處；其無法追回者，應由失職人員負責賠繳。

五十、短付情事之補付，財政局應按原付款憑單短付金額補發之，並通知
      有關機關。

五十一、市庫支票註銷之處理：
        (一)已簽發之市庫支票，因故無須支付時，應由原機關填具市庫
            支票註銷申請書連同市庫支票，向財政局辦理註銷作廢手續
            。
        (二)原市庫支票註銷後仍須支付時，應由原機關填具市庫支票註
            銷申請書，連同市庫支票，向財政局辦理註銷並依下列規定
            辦理：
             1、未逾會計年度者，應另行簽開付款憑單。
             2、已逾會計年度者，依支票換發程序辦理。